La mega diversidad de Perú es reconocida a nivel mundial, esto debido a su geografía heterogénea, de la cual más del 60% de su territorio se encuentra en la cuenca amazónica. Aquí la vida del mundo natural se manifiesta exuberantemente, y sin caer en exageraciones, podemos decir que es un verdadero paraíso natural donde se encuentra la mayor concentración de especies de nuestro planeta, como mamíferos, insectos, aves, reptiles, plantas y otras formas de vidas, las cuales muchas de ellas todavía aún no se han estudiado y muchas otras aún ni siquiera se han descubierto. Sin embargo, el peligro y la amenaza que confronte este mundo natural, es una realidad latente, y si el ser humano no cambia sus actitudes con relación al justo uso de sus recursos naturales, probablemente el ser humano no tendrá la oportunidad ni si quiera de enterarse de la existencia de muchas especies. Es así que, estas irán desapareciendo para siempre antes de ser conocidas. Si esto parece poco, no olvidemos que por lo meno el 25% de todos los fármacos conocidos y utilizados en el mundo, son frutos de mecanismos químicos encontrados en la farmacia más grande del mundo: la selva amazónica, de la que hoy en día ni si quiera conocemos el 5% de lo que existe en ella.

En estos últimos 100 años la destrucción de las cuencas amazónicas ha sido constante y exagerada, para todas las formas de vida "incluyendo las poblaciones indígenas" presentándose un mayor impacto a lo largo de todas las vías de comunicación accesibles, como carreteras y ríos navegables. Debido a esta razón, los últimos bosques de menor impacto humano se encuentran en las laderas orientales de la gran cordillera de los andes, donde una geografía fuertemente agreste frenó la insaciable codicia de nuestra "civilización", de la misma manera el acceso fluvial por el lado este, se vuelve demasiado peligroso al aproximarse de las laderas andinas donde las aguas se vuelven muy caudalosas, dificultando así la extracción y comercialización de tanta riqueza.

Penetrar en la cuenca amazónica teniendo como punto de salida la ciudad de Cusco, nos brinda la oportunidad de atravesar uno de los bosques más inexplorados del planeta, y la oportunidad también de asistir a un descenso gradual que varía desde los 3500 msnm, hasta llegar a las faldas de la gran cordillera de los andes aproximadamente a 350 msnm. La diversidad de ecosistemas que se atraviesan en este descenso, es prácticamente desconocida por falta de estudios adecuados, el número de endemismo es incalculable. Los secretos que la naturaleza todavía guarda celosamente podrían ser la solución de muchas enfermedades que afligen al ser humano, y lamentablemente día a día va desapareciendo delante de nuestros incrédulos ojos.

La riqueza ecológica del parquet Nacional del Manu es importante. La zona contiene más de 20.000 especies de plantas. En el Manú es posible encontrar toda la variedad de pisos ecológicos que existen en la Amazonía y esto la hace una de las más apreciadas. En una sola hectárea se han llegado a encontrar hasta 250 variedades de árboles.

El Manú es biodiverso, contiene más de 20.000 tipos de plantas, 1.000 especies de aves, 1.200 de mariposas y 200 de mamíferos entre los que destacan el jaguar, el lobo de río y 14 monos como el leoncito, el más pequeño del mundo con 100 g de peso y la maquisapa de 9 kg

Mamíferos:    159 especies
Reptiles:        99 especies
Anfibios:        140 especies
Aves:            800 especies
Peces:           210 especies

Insectos hay varios que aún no se les ha designado una clasificación científica
Mariposas:     1307 especies
Hormigas:      300 especies
Anisópteros:   136 especies
Abejas:          650 especies

El Parque Nacional del Manu es el parque protegido con mayor diversidad biológica en el mundo.